La Federación Española de Médicos Homeópatas está formada por once asociaciones de diferentes comunidades autónomas: Academia de Homeopatía de Asturias, Academia Médico Homeopática Canaria, Asociación Andaluza Médico Homeopática Similia, Asociación de Médicos Homeópatas de Andalucía, Asociación Médico Homeopática de Mallorca, Asociación Médico-Homeopática de Santa Cruz de Tenerife, Asociación Vasco Navarra de Médicos Homeópatas, Sociedad Científica de Homeopatía de Aragón, Sociedad Gallega de Medicina Homeopática, Sociedad Hahnemanniana Matritense y Sociedad Médico Homeopática de la Comunidad Valenciana.